La Crucifixion est située au troisième étage, sur la partie la plus haute de l'atrium. Le Christ est représenté les pieds déliés, pendu à une croix de fer marquée d'un "I" rouge sur la poutre centrale symbolisant l'inscription latine "INRI". À ses pieds, à côté du groupe de saint Jean, on trouve sa Mère ainsi que Marie-Madeleine. De l'autre côté, l'unique élément est un crâne qui représente la mort et fait allusion au Golgotha, aussi appelé la "montagne des crânes", où eut lieu la crucifixion. En dessous, Véronique tient un linge avec lequel elle essuie la sueur du front de Jésus. Le tissu porte l'empreinte du visage du Christ. L'absence de visage de Véronique permet de concentrer l'attention sur Jésus. Un détail intéressant de cette scène est la présence d'un évangéliste, à gauche, dont l'image rappelle celle d'Antoni Gaudí.