La Cène secrète est un apocryphe bogomile qui a exercé une influence certaine sur la formation de la pensée cathare. Ce document faisait partie des livres mystiques sur lesquels les Cathares de France et d'Italie appuyaient leur foi. La version latine date du XIIIe siècle mais le texte en ancien bulgare paraît remonter au moins au XIIe siècle.
C'est un "faux évangile" où saint Jean est censé interroger Jésus-Christ sur l'organisation du monde par le Diable au cours d'une "Cène secrète du royaume des cieux" dont la Cène historique n'aurait été, au dire de certains Cathares, que l'image temporelle.